Etter å ha bekjempet en ond drage og reddet en vakker prinsesse og hennes familie sitt kongedømme, hva mer kan ett troll gjøre? Vel, når det gjelder Shrek så har han endt opp som en hjemmekjær familiefar. I sin lengsel etter gamle dager da han virkelig følte seg som et troll, inngår Shrek en pakt med den sleske Rumpelstiltskin. Før han vet ordet av det er livet forvandlet og han befinner han seg i en merkelig, alternativ variant av landet Langt, Langt borte. Her blir trollene jaktet på, Rumpelstiltskin er konge og Shrek og Fiona har aldri møtt hverandre. Nå er det opp til Shrek å gjøre ugjort det han har gjort og redde sine venner, gjenopprette livet sitt og gjenvinne sin store kjærlighet.