I 1583 drar Bent Jonsson til Oslo for å søke biskop og stattholder om tillatelse til ekteskap mellom sin frilledatter Ingeborg og sin fetter Amund Toresson. Hjemme på Glømsdal tilstår Bents hustru Anne at hun har drevet med trolldom. Bent tar seg til Bergen. Hans tilknytning til Anne Pedersdotter er like sterk. Hun blir stadig beskyldt for å være heks, og nå er det for sent for Bent å gripe inn. I Bergen møter han også kaperkapteinen Magnus Heinessøn, en mann han føler en merkelig dragning til. Hver på sin måte hjelper Anna Pedersdotter og Magnus Heinessøns skjebner Bent til å finne sin egen vei - selv om han nesten går under på det.

Skjærsild er femte og siste bind i serien om Bent Jonsson.