Fattiggutten Mikkel er med Tønnes på handelsskipet som faren hans, Gudmund Herre, eier. De har lagt til havn i Trondhjem. Mens de besøker Nidarosdomen, kommer Mikkel over to banditter som planlegger å rane skipet til Gudmund Herre. Mikkel forsøker å forhindre dette, men blir oppdaget og havner i krypten under kirkegulvet. Mikkel må finne veien ut av den mørke, klamme og skumle kjelleren og overliste skurkene før de stjeler Gudmunds pengekiste. Mysteriet i Nidarosdomen må løses. Mikkel og Tønnes opplever mange eventyr rundt omkring i Norge når de reiser fra by til by. I hver by de kommer til opplever de morsomme, nifse og mystiske ting. Etter hvert blir de drevne detektiver, som tar opp kampen med både skurker og spøkelser. Fortelling for mellomtrinnet.